Capacitación en el uso de técnicas de metagenómica para la identificación del virus de la tilapia del lago y otros agentes patógenos virales para peces en aguas destinadas a la acuicultura

Abstract

La pasantia se realizará en el Departamento de Ciencias Básicas y Medicina Acuática (BASAM) de la Universidad Noruega de Ciencias de la Vida (NMBU), institución que cuenta con profesionales especializados en el área de ciencias veterinarias en organismos acuáticos con un enfoque de diagnóstico e investigación mediante métodos moleculares de última generación y con énfasis en análisis de patógenos para la Acuicultura a nivel medioambiental. Asimismo cuenta con laboratorios de biología molecular especializados en secuenciamiento de organismos mediante la tecnología Illumina y en la detección de patógenos ambientales mediante metatrasncriptomica, data que es analizada mediante los servidores de computación que tiene la NMBU para los análisis bioinformáticos de la big data de los secuenciamientos. El objetivo de la pasantia es la Capacitarse en las técnicas de análisis metagenómicos (shotgun metagenomics / metatranscriptomics) para la identificación de patógenos virales en muestras ambientales, en la aplicación de herramientas bioinformáticas para evaluar datos metagenómicos de muestras ambientales y en el análisis multivariado y la agrupación taxonómica utilizando enfoques basados en OTU para complementar los análisis de datos metagenómicos. El conocimiento adquirido resultado de la capacitación, sera difundido a través de una charla de difusión tecnológica en las instalaciones del ITP/CITEacuícola de Ahuashiyacu, dirigido a autoridades, profesionales, estudiantes y actores estratégicos de la Acuicultura en la región San Martín y a nivel nacional.